查文獻看似很簡單,在搜索引擎中輸入想要查找的關(guān)鍵字,點擊搜索就完成了~
這樣做確實沒問題,但是在現(xiàn)在浩如煙海的信息面前,這樣查出來的文獻需要我們耗費大量的時間來篩選過濾才能找到我們想要的目標,或者就是像題目中所說的,關(guān)鍵詞不恰當導致搜不到文獻。
這里我們就教大家一些文獻搜索的高級技巧,幫助大家在文獻搜索第一步就將范圍精確縮小,后面我們還會介紹一個神器,你只需要輸入一篇論文,他就可以幫你將這篇論文引用和相關(guān)的論文都給你找出來,再也不怕找不到文獻讀了~
一、PubMed高級檢索技巧


1. 基本檢索

①布爾運算
也叫邏輯運算,即“與”、“或”及“非”,對應“AND”、“OR”及“NOT”,注意必須為大寫字母,分別對應交集、聯(lián)集和差集。
如我們需要檢索“人參皂苷在治療冠心病的應用”,這時可提取兩個關(guān)鍵詞“人參皂苷”和“冠心病”,就可以使用[ginsenosides AND “coronaryheart disease”]進行檢索。

需要注意的是,邏輯算符具有優(yōu)先順序,優(yōu)先級為:NOT>AND>OR。
②括號()
使用邏輯算符進行檢索時,如果需要改變優(yōu)先順序,就可以添加括號,類似于數(shù)學中的邏輯,括號內(nèi)的先運算。如使用[Ginsenosides AND ("Cervical cancer" OR "coronary heart disease")]和[Ginsenosides AND "Cervical cancer" OR "coronary heart disease"]進行檢索的結(jié)果數(shù)量有明顯的差距。

③星號*
截詞符號,指在檢索詞的適當位置截斷。使用截詞檢索可對關(guān)鍵詞的一個局部進行檢索,檢索結(jié)果為凡滿足這個詞局部中的所有字符(串)的文獻,使用截詞檢索可有效提高查全率。如[chemotherap*] 可查到[chemotherapy]、[chemotherapautic]、[chemotherapeutical]等不同的詞性拼法。

④引號“”
如果關(guān)鍵詞包含多個詞,不想分開,可以使用引號包覆詞組進行檢索。如我們直接使用“coronary heart disease”進行檢索,檢索結(jié)果會將三個單詞分開,檢索結(jié)果可能并不是我們想要的。

添加引號進行檢索,檢索結(jié)果就精準了許多。



2. 限定檢索

使用更細節(jié)的檢索方法可以更精準地獲取文獻,如引入作者、期刊名、文章發(fā)表時間等。要實現(xiàn)這樣的功能,可在檢索時引入字段標記。比如我們要查詢“MarchantI”這個作者的文章,可以使用“Marchant I[au]”進行檢索,其中“au”表示“author”,即作者,這樣檢索結(jié)果均為該作者發(fā)表的文章了。

再比如我們使用“STAT3[ti]”進行檢索,表示檢索結(jié)果中文獻的標題必須有關(guān)鍵詞“STAT3”,其中“ti”表示“title”,即標題。



3. 高級檢索

在檢索框下方點擊“Advanced”可進入高級檢索界面,在高級搜索條件下,我們可以通過添加具體條件和運用邏輯符號更加精確地檢索想要的文獻。

高級檢索界面主要包含三個部分,很容易理解。
?第一個部分“Add terms to the query box”可下拉式選擇檢索方式,可以很容易的實現(xiàn)組合檢索;
?第二部分“Query box”為自主書寫檢索式進行檢索,我們在第一部分設置檢索時,這里會自動生成檢索式,當然也可自己直接書寫檢索式;
?第三部分“History and Search Details”記錄了檢索歷史和檢索式,我們也可將自己的檢索式保存,下次可直接使用。

比如我們需要檢索發(fā)表在J Enzyme Inhib Med Chem期刊上且標題含有“STAT3”的文獻,可以如下設置:




4. Mesh主題詞檢索

主題詞檢索也是PubMed常用的檢索方式,比基本檢索更具優(yōu)勢。主題詞檢索一般包括主題詞和副主題詞兩部分,主題詞是將文獻研究的主要論點概括成(標引)一個或多個規(guī)范化的語詞。副主題詞是對主題詞的某一特定方面的限定,具有專指性。
在PubMed首頁可以找到“MeSH Database”的入口,點擊該鏈接可進入主題詞檢索界面。

比如以糖尿病“Diabetes Mellitus”進行檢索,在檢索結(jié)果界面找到自己要檢索的主題詞;

這里我們點擊第一條結(jié)果“Diabetes Mellitus”,在該界面可以查看副主題詞和主題詞的其他信息。副主題詞可以添加多個,也可以不添加。我們這里勾選“diagnosis(診斷)”和“therapy(治療)”;

然后在頁面右側(cè)的“PubMed Search Builder”工具塊點擊“Add to search builder”生成檢索式,之后點擊“Search PubMed”進行檢索即可。

如果還需要加入其它檢索條件,可以利用歷史檢索模塊,進行邏輯組配再檢索。
二、文獻探索和信息挖掘的線上可視化工具Connected Papers
下面給大家介紹一款文獻探索和信息挖掘的線上可視化工具Connected Papers
(https://www.connectedpapers.com/),它將相關(guān)領域已發(fā)表論文進行關(guān)聯(lián)分析。
運用Connected Papers檢索文獻非常方便,目前支持文章標題、DOI號、以及arXiv、Semantic Scholar 和 PubMed多種來源文章的URL檢索。
在Connected Papers上我們輸入一篇典型文章,獲取相關(guān)領域的論文可視化圖表,輔助我們快速了解該領域的熱點、趨勢和動態(tài)。
在某些領域,近期發(fā)表的論文由于被引量少較難追蹤,但Connected Papers可以讓我們輕松發(fā)現(xiàn)最近的一些重要文章。

圖1 Connected Papers首頁
來源:網(wǎng)頁截圖,如無特殊說明
本文圖片均源于網(wǎng)頁截圖
下面介紹一些簡單用法
1)輸入目標文章標題/DOI/URL(關(guān)鍵詞亦可)
以小編最近在看的一篇2009年發(fā)表在Soil biology & biochemistry文章為例。輸入文章標題——“Arbuscular mycorrhizal fungi contribute to 13C and 15N enrichment ofsoil organic matter in forest soils”。

圖2 文章檢索界面
2)點擊“Build a graph”來生成可視化圖片:
這個過程視相關(guān)文章數(shù)目而定,數(shù)目越多耗時越長,一般情況下1-2分鐘足矣。
3)分析結(jié)果解讀:
如圖所示,我們把結(jié)果界面劃分為3個區(qū)塊。

圖3 相關(guān)文獻分析可視化結(jié)果
①最左側(cè)為相關(guān)文獻名列表。
第一篇文章即我們輸入的original article。默認依據(jù)文章與原始文章之間的相似度排序,相似度越大越靠前。如需查看列表文章的詳細屬性,可以點擊“Expend”轉(zhuǎn)到列表視圖。在此視圖下,我們可以根據(jù)文章發(fā)表年份及被引量等進行重新排序。若想回到圖片視圖,點擊“Collapse”即可。

圖4 文獻分析結(jié)果的List視圖
②中間為可視化圖形。
看不懂圖片可以直接點擊幫助圖標,每一個節(jié)點代表一篇文獻,節(jié)點大小表示文獻被引量多寡,節(jié)點顏色由淺入深表示年代由遠及近,節(jié)點之間連線越深暗示兩篇文獻之間相似度越高,同時相似度高的文獻會在圖片中聚集在一起。具黑色環(huán)帶的節(jié)點示原始文獻,鼠標滑過非原始文獻的節(jié)點均會產(chǎn)生白色環(huán)帶予以區(qū)分。

圖5可視化圖形案例
案例展示了相關(guān)領域的41篇文章,最早可追溯到
1996年,其中2006年Rilling等發(fā)表的文章
“Mycorrhizasand soil structure”被引次數(shù)最多
③最右側(cè)為指定文章的詳細信息。
包含了標題、作者、發(fā)表年份、被引量、參考文獻數(shù)目及摘要。點擊“Paper details”鏈接到“Semantic Scholar”學術(shù)搜索引擎,可以在線預覽圖表(這一點可以說是非常nice了),甚至可以直接獲取全文。

圖6 Semantic Scholar 文獻簡介界面
有意思的是,點擊頁面左上角的“Prior works”,中間一欄跳轉(zhuǎn)為本文的背景文獻,輔助研究者追本溯源。藍色部分示意直接引用的文獻,而白色部分表示雖未被直接引用但內(nèi)容密切相關(guān)的文獻。點擊“Prior works”中的文獻名稱將在左側(cè)相關(guān)文獻名列表中高亮所有引用過該文獻的文章。而在左側(cè)點擊一篇相關(guān)文獻,“Prior works”中將高亮該文章所引用的所有文章。

圖7 “Prior works”界面截圖
相信大家也都猜到了,點擊“Derivative works”可以查看引用了以上圖譜中文章的文獻,便于我們掌握最新動態(tài)。玩法和“Prior works”類似,不再贅述。

圖8 “Derivative works”界面截圖
本文介紹了兩種文獻檢索的高階技巧和工具,應該能夠幫助各位剛剛接觸科研的小伙伴找到自己想要的文獻了~大家快快試用起來吧~

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